Ce projet communautaire, non gouvernemental et sans but lucratif a vu le jour, en effet, grâce aux efforts conjugués des collectivités de base dans la région de Ngozi (population, administration de base, confessions religieuses, associations de développement et particuliers). Il a été également initiée en pleine guerre civile dans le but de proposer une alternative à la violence et d’offrir une espérance aux jeunes qui voulaient étudier malgré le conflit L’Université de Ngozi a été implantée dans la province de Ngozi, au nord du pays, dans un environnement et un climat favorable aux études, dans de bonnes conditions sociales non discriminatoires et hors des problèmes sociopolitiques. Toutefois, elle a ouvert, avec le temps, un campus dans la ville de Bujumbura qui abrite actuellement la faculté de Médecine.
