Pour mettre en exergue ses valeurs sous forme d’objectifs, de programmes et de finalités, l’Université de Ngozi se fixe des missions fondamentales suivantes:

• Former le personnel de haut niveau, scientifiquement et techniquement qualifié, adapté au contexte africain et du monde moderne, conscient de ses responsabilités vis-à-vis de son peuple et capable de les servir avec dévouement
• Développer la Recherche dans les disciplines clés de la Science, de la Technique et de la Culture ;
• Mobiliser l’ensemble des ressources intellectuelles au service du développement économique et culturel du Burundi, et participer à la résolution des problèmes nationaux et sous régionaux.